miR-203a-3p.1调控VCAN作为胃癌潜在治疗靶点的生物信息学研究

作者：智鹏柯; 石见; 周博; 杨言通; 陈晔^*

来源：检验医学与临床, 2022, 19(14): 1882-1890.

• 胃癌
• VCAN
• miR-203a-3p.1
• 差异表达基因
• 生物信息学

目的 采用生物信息学技术探讨胃癌发生及进展的机制。方法 采用GEO分析数据集GSE54129中胃癌组织标本与正常胃黏膜组织标本的差异表达基因(DEGs),然后用DAVID数据库对DEGs进行富集分析，STRING构建蛋白质相互作用(PPI)网络，Cytoscape软件可视化，MCODE和cytoHubba筛选关键基因，并在GEPIA数据库及胃癌组织标本中验证关键基因，之后用Target Scan7.2数据库预测调控靶基因的miRNAs。结果 共筛选出630个DEGs(305个上调基因及325个下调基因),富集分析结果提示DEGs主要参与细胞外基质组织形成、蛋白质细胞外基质、肝素结合、化学致癌信号通路。进一步构建PPI网络，利用Cytoscape7.2数据库进行可视化分析，最终确定3个关键DEGs,包括VCAN、IGFBP7、FSTL1。利用GEPIA数据库验证关键DEGs,结果证实VCAN在胃癌组织中高表达(P<0.05),并与胃癌患者的不良预后有关。Target Scan7.2数据库预测结果提示has-miR-203a-3p.1可与VCAN mRNA的3′UTR结合。结论 has-miR-203a-3p.1调控的VCAN是胃癌潜在治疗靶点。

• 单位
  河南科技大学第一附属医院; 神经内科