云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因进化特征分析

作者:叶丛华; 张文东; 宋建领; 李静; 田建国; 吕粤; 岳亮; 邱薇; 李刚山; 冯子良; 郑颖; 张思东; 范泉水; 张应国; 王双印; 张富强
来源:中国卫生检验杂志, 2009, (06): 1216-1218+1247.

摘要

目的:认识2003年~2008年期间云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因的进化特征。方法:2003年~2008年期间在云南边境采集境外禽类样品380份,经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果:多重RT-PCR检出18份阳性样品,阳性率4.74%;14份代表性病毒样品HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于93.1%~99.3%、90.5%~99.1%;HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;系统发育分析表明阳...