基于生物信息学方法研究IgA肾病患者肾组织的核心基因及免疫微环境

作者：白雅雯; 李雅静; 席亚莉; 麻春杰^*

来源：中国中西医结合肾病杂志, 2023, 24(07): 605-661.

• IgA肾病
• 生物信息学
• 核心基因
• 免疫微环境

目的:通过生物信息学方法分析IgA肾病患者肾组织的核心基因和免疫细胞浸润特点，探索IgA肾病的发病机制。方法:从GEO数据库下载GSE104948、GSE104954、GSE37460和GSE35487的基因表达矩阵，运用R语言筛选差异表达基因，利用STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络，并计算核心基因。运用CIBERSORTx数据库分析不同组别的免疫细胞浸润特点。结果:共获得218个差异表达基因，筛选出22个核心基因，如C1QA、C1QB、CD48、CD53、CSF1R等。与正常组相比，IgA肾病患者肾组织中初始B细胞、记忆CD+4T细胞、树突状细胞、活化肥大细胞和中性粒细胞水平降低；M0型巨噬细胞、M1型巨噬细胞和M2型巨噬细胞、NK细胞、单核细胞、静息肥大细胞水平增高。结论:IgA肾病肾组织免疫细胞以巨噬细胞浸润为主要特点，其核心基因主要与炎性反应和免疫调节紊乱有关。

• 单位
  内蒙古医科大学