1株溶血色杆菌的分离鉴定与基因组分析

作者：王茜月; 管飘萍; 陈诗涵; 黄紫贝; 郭鑫; 赵以恒; 罗健雅; 王欣宇; 崔颢月; 刘金彪; 王海燕; 刘文博^*

来源：江苏农业科学, 2022, 50(12): 42-50.

DOI：10.15889/j.issn.1002-1302.2022.12.007

• 池塘
• 溶血色杆菌
• 全基因组序列
• 比较基因组分析

从池塘中分离、纯化了1株具有极强溶血活性的革兰氏阴性杆菌BB2,在TSA培养基上菌落呈灰色、半透明圆形，经16S rRNA基因序列分析确定为色杆菌属，但无法确定到种；进一步全基因组测序结果表明，该菌株与GenBank中唯一的1株稻根色杆菌基因组同源性最高，但生物学特性又不一致。文献逆索发现其命名为稻根色杆菌主要是由于其分离于水稻根部，这对分类造成了困惑。最终依据细菌形态特征、生理生化特性、16S rRNA和全基因组序列分析及文献分析等综合信息，确定分离菌BB2为溶血色杆菌，这提醒研究者们在细菌鉴定时应谨慎使用GenBank数据序列数据，一定要对相关参考文献进行全面认真研读，获取必要的证据，为最终分类提供科学依据。本研究也为进一步研究该分离株的生物学特性和应用提供了参考和基础。

• 单位
  江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心; 扬州大学; 江苏农牧科技职业学院