基于免疫相关lncRNA构建晚期乳腺癌预后预测模型

作者：高涵琛; 杨沐; 王庆庆^*

来源：实用妇科内分泌电子杂志, 2020, 7(15): 33-48.

DOI：10.16484/j.cnki.issn2095-8803.2020.15.022

• lncRNA
• 晚期乳腺癌
• 预后
• 生物信息学分析

目的本研究通过肿瘤与癌症基因组图谱(TCGA)数据库筛选出免疫相关lncRNA,建立辅助晚期乳腺癌患者免疫治疗决策制定的预后预测模型。方法从TCGA数据库下载264晚期乳腺癌患者RNA测序数据和临床信息,通过R语言和Perl软件筛选出影响晚期乳腺癌患者预后的免疫相关lncRNA,并建立预后预测模型。采用KaplanMeier生存曲线验证预测模型预后价值;主成分分析(PCA)验证免疫状态;ROC曲线下面积(AUC)验证模型预测准确性。结果本研究最终得到了5个与晚期乳腺癌患者预后相关的免疫lncRNA,其中MIR210HG、LINC015545与较长总生存期相关,AC234775.3、TNFRSF14-AS1、AC138932.5与较短总生存期相关。依据lncRNA表达量及风险系数构建预后预测模型,并对患者评分。根据分数中位值将晚期乳腺癌患者分为高、低风险组;生存分析结果显示,高风险组比低风险组有更差的预后(p<0.05);免疫相关lncRNA的组间分布差异不明显,模型lncRNA组间分布具有显著差异;AUC为0.965。结论基于5个免疫相关的lncRNA构建的预后预测模型能够较好的预测晚期乳腺癌患者的生存状态,可成为晚期乳腺癌患者中免疫治疗有效性的参考指标,对治疗决策的制定具有潜在价值。

• 单位
  南通大学附属医院; 南通大学