欧李ChCBF1基因的克隆及生物信息学分析

作者：汪泽文; 穆霄鹏; 王鹏飞; 张建成; 杨依维; 付鸿博; 杜俊杰^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(08): 2490-2496.

DOI：10.13271/j.mpb.018.002490

• 欧李,
• 转录因子CBF1
• 生物信息分析

本试验在欧李基因组研究的基础上,利用RT-PCR方法从低温处理的‘农大4号’欧李叶片中克隆到了ChCBF1基因,该基因CDS序列长度为690 bp,编码229个氨基酸的蛋白,分子量为25.10 kD,等电点为4.94,蛋白不稳定指数为58.72。二级结构主要由α-螺旋,延伸链,β-折叠和无规则卷曲构成。启动子分析表明,ChCBF1基因的启动子元件包括低温响应元件、多个光响应相关元件以及激素响应元件等一系列诱导型顺式调控元件。通过氨基酸同源比对和系统发育树分析发现,ChCBF1基因编码的氨基酸序列与桃的相似性最高,达到95%。本研究为后续逆境与休眠诱导相关方面的基因功能验证提供了帮助。

• 单位
  黑龙江省农业科学院; 山西农业大学