利用二代测序技术对45例疑似Lynch综合征肿瘤的基因变异分析

作者:姚志刚; 程显魁; 林存虎; 李佳; 吕蓓蓓; 李加美; 井海燕; 覃业军; 孙锡超*
来源:中华肿瘤杂志, 2021, 43(08): 843-849.

摘要

目的探讨二代测序(NGS)技术在Lynch综合征相关基因胚系突变检测中的价值。方法采用免疫组化方法检测2016—2018年在山东省立医院手术切除的肿瘤组织中MutL homolog 1 (MLH1)、PMS1 homolog 2(PMS2)、MutS homolog 2(MSH2)和MutS homolog 6(MSH6) 4种DNA错配修复(MMR)蛋白的表达情况。根据MMR的表达情况和临床资料, 选取45例疑似Lynch综合征患者, 提取其经显微镜证实无癌累及正常组织的DNA, 对MLH1和MSH2等12个基因进行NGS测序分析, 应用生物信息学技术分析基因胚系突变位点和意义。采用Sanger测序对10例患者的可疑致病位点进行验证。结果免疫组化检测显示, 45例肿瘤组织标本中, MLH1和PMS2表达缺失22例, MSH2和MSH6表达缺失16例, MMR蛋白表达正常7例。NGS显示, 28例结肠癌患者的正常组织样本中, 4例有MLH1致病性突变, 1例有MLH1疑似致病性突变, 2例有MSH2致病性突变, 2例有MSH2疑似致病性突变。6例直肠癌、6例胃癌和7例免疫组化检测MMR表达正常结直肠癌患者的正常组织样本中均未见明显MMR基因突变。5例子宫内膜癌患者的的正常组织样本中, MLH1和MSH2致病性突变各1例, MLH1疑似致病性突变1例。此外, NGS还检测到许多其他基因异常和未见报道的基因突变。Sanger测序均检测到与NGS检测结果相同的MLH1和MSH2基因突变位点。结论高通量NGS技术可以快速、准确、可靠地检测到疑似Lynch综合征患者的异常基因, 对消化道等遗传性肿瘤的相关基因检测具有广阔的应用前景。