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摘要
柑橘几丁质酶基因cs8g01810位于第8染色体上，它可能在柑橘抗真菌病的过程中起重要作用，为了在柑橘的抗病育种中快速鉴定该基因，需要开发与该基因紧密连锁的分子标记。本研究通过在柑橘基因组测序数据库中检索，获得该基因上游50 kb和下游50 kb的基因组DNA序列，再使用SSRIT软件寻找这段序列中的短串联重复序列，从而设计引物扩增，筛选获得基因连锁的SSR分子标记。以甜橙、砂糖橘、贡柑、沃柑4个品种的基因组DNA作为模板进行PCR扩增，将产物进行电泳比较和测序验证后，开发出4个与柑橘cs8g01810基因紧密连锁的SSR分子标记，它们与cs8g01810基因的物理距离在11 kb～47 kb之间，扩增产物长度在70～212 bp之间，在不同柑橘品种中长度变异在2～9 bp之间，通过PCR扩增和3%琼脂糖凝胶电泳得到有效区分。开发的SSR分子标记将在分子辅助育种、基因图位克隆和种质资源鉴定等过程中发挥重要作用。
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单位生命科学学院; 肇庆学院
