缺血性脑卒中缺氧相关生物标志物的筛选

作者:胡彦兵; 达吾提江·依拉木; 郭雄; 潘红波; 何康民*
来源:中风与神经疾病杂志, 2023, 40(07): 628-635.
DOI:10.19845/j.cnki.zfysjjbzz.2023.0145

摘要

目的 研究缺氧相关基因与缺血性脑卒中之间的关系,筛选缺氧相关的分子标志物。方法 首先,下载GSE16561和GSE58294数据集,以及缺氧相关基因集,筛选缺氧相关的差异表达基因,并进行功能注释。随后对这些差异表达的缺氧相关基因进行最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归和支持向量机算法分析,筛选缺氧相关的生物标志物,并对缺血性脑卒中组和对照组的差异免疫细胞进行分析。最后对转录因子和miRNA进行了预测。结果 本研究共筛选得到13个缺氧相关的差异表达基因,这13个基因主要富集到了葡萄糖跨膜转运、单糖跨膜转运以及线粒体自噬调节等过程。基于LASSO回归和支持向量机算法,最终确定了8个缺氧相关的生物标志物,这些标志物与大部分免疫细胞之间均存在显著相关性。此外,预测到8个基因对应的209个转录因子的关系网络,以及6个基因对应的25个miRNA。结论 本文最终筛选了8个缺氧相关的生物标志物,它们可能作为抑制卒中后的脑损伤的治疗靶点。此外,糖代谢和免疫机制在缺血性脑卒中的发生和发展中发挥重要作用。

  • 单位
    喀什地区第二人民医院