2016—2017年河北正定县、湖南湘潭县及浙江玉环市轮状病毒VP7基因的分子流行病学特征

作者：陈红; 李庆亮; 段凯; 石晨; 张东; 董犇; 白萱; 乔建; 徐葛林; 杨晓明^*; 高招; 李放军; 吕华坤^*; 周海松; 鄢廷栋; 施海云

来源：中国生物制品学杂志, 2021, 34(04): 415-431.

DOI：10.13200/j.cnki.cjb.003311

• 轮状病毒
• VP7基因
• 分子流行病学
• 系统进化分析

目的分析2016—2017年河北正定县、湖南湘潭县及浙江玉环市轮状病毒(rotavirus,RV)VP7基因的分子流行病学特征。方法收集2016—2017年上述3个地区RV感染者粪便样本,采用RT-PCR法扩增RV阳性样本的VP7基因片段,并进行测序分型。同时对VP7基因核苷酸序列进行同源性分析,并构建进化树;将核苷酸序列翻译为氨基酸序列,分析原型株及UK-人重配疫苗毒株与3个地区样本VP7氨基酸序列的差异。结果测序结果共有G1、G2、G3、G9 4种基因型,所占比例分别为5.1%(10/199)、21.6%(43/199)、6.0%(12/199)、67.3%(134/199);4种G基因型RV与相应原型株进化距离较远,核苷酸序列相似性分别为90.6%～91.9%、83.5%～94.0%、82.6%～97.2%、75.8%～89.8%;与原型株及UK-人重配疫苗毒株比较,4种G基因型RV可变区分别有15、12、17、32个氨基酸位点存在差异。结论同一时间不同地区RV的G基因型优势流行株不同,流行株G9的优势亚型也会随时间发生变化,应加强对病毒的流行病学监测。

• 单位
  武汉生物制品研究所有限责任公司; 湖南省疾病预防控制中心; 湘潭县疾病预防控制中心; 河北省疾病预防控制中心; 浙江省疾病预防控制中心