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摘要
目的：基于白术转录组数据的筛选和分析，掌握不同产地白术根之间差异表达基因的信息。方法：通过Illumina HiSeq测序平台进行转录组分析，利用Trinity软件对Clean reads进行组装，基于FPKM值的log2倍数绝对值大于1及错误发现率小于0.05为标准筛选DEG。将DEG在公共数据库中进行比对获得功能注释，根据注释信息挖掘白术萜类生物合成关键酶基因，并分析不同产地白术的表达量差异。结果：转录组测序共获得71 086条Unigene, N50长度为1 524 bp。从湖北与河北、安徽与湖北、安徽与河北白术之间分别筛选到2 333、1 846、1 239个DEG,其中在GO数据库中获得注释的DEG分别有1 424、1 091、731个，在KEGG数据库中获得注释的DEG分别有432、321、208个，这些DEG主要与代谢过程和次生代谢产物代谢途径相关。根据DEG在数据库中的功能注释信息，挖掘到5个萜类生物合成关键限速酶基因，这些基因在湖北白术中表达量最高，说明湖北白术中萜类合成更活跃。结论：该研究系统分析了不同产地白术间的差异表达基因，为进一步挖掘功能基因和研究有效成分的分子调控机制提供了理论依据。
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单位中国中医科学院; 重庆市中药研究院
