白羽绿头鸭骨骼肌发育内参基因的鉴定和筛选

作者：赵明明; 刘博; 吴琼; 赵家平; 涂剑锋^*

来源：黑龙江畜牧兽医, 2021, (23): 122-129.

DOI：10.13881/j.cnki.hljxmsy.2021.04.0294

• 白羽绿头鸭
• 内参基因
• 骨骼肌发育
• 稳定性
• 筛选

为选取适宜进行白羽绿头鸭骨骼肌发育相关基因研究的内参基因,试验通过实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)对13个候选内参基因进行表达稳定性验证,利用geNorm、NormFinder软件评估候选内参基因稳定性,利用BestKeeper软件对geNorm和NormFinder软件评估结果中稳定性排前10位的候选内参基因进行稳定性分析,用RefFinder软件对内参基因稳定性进行综合评价,并通过geNorm软件确定最适内参基因数量。结果表明:geNorm软件评估结果显示SEC61G与NDUFB3组合内参基因稳定性最高,HPRT1基因稳定性最低,最适内参基因数为2个;NormFinder软件评估结果显示NDUFB3稳定性最高,HPRT1基因稳定性最低;BestKeeper软件评估结果显示SAT1稳定性最高,GAPDH基因稳定性最低;Refinder软件评估结果显示候选内参基因稳定性从高到低依次为NDUFB3>SEC61G>SOD1>SAT1>TOP2B>ATP5MF>HMBS>HINT1>GAPDH>YWHAZ>RPS2>ACTB>HPRT1,HPRT1的表达最不稳定,NDUFB3基因表达最稳定。说明在白羽绿头鸭骨骼肌发育中,最佳内参基因为NDUFB3,最佳内参基因组合为NDUFB3和SEC61G,2个内参基因最佳。

• 单位
  龙岩学院; 生命科学学院; 中国农业科学院特产研究所