三角帆蚌溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1 HcLPCAT1基因功能分析及壳色性状相关SNP筛选

作者：张进盼; 白志毅^*; 张梦莹; 颜玲; 陆风辉; 王贺

来源：中国水产科学, 2021, 28(11): 1373-1384.

• 三角帆蚌
• LPCAT1基因
• 类胡萝卜素
• SNP标记
• 内壳色

溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶1(LPCAT1)是一种重要的脂质代谢酶。为明确三角帆蚌(Hyriopsiscumingii)HcLPCAT1基因在类胡萝卜素代谢中的功能,探究该基因与三角帆蚌壳色的相关性,本研究采用RACE技术克隆获得HcLPCAT1基因cDNA全长1675 bp,ORF区1296 bp编码431个氨基酸;实时荧光定量分析发现HcLPCAT1基因在紫色三角帆蚌各组织中表达量均高于白色三角帆蚌相应组织,且在肝胰腺、外套膜中的表达量差异显著(P<0.05);原位杂交检测到的阳性信号主要定位在外套膜的外褶、背膜区、腹膜区,外褶与中褶连接处以及部分中褶;紫色三角帆蚌补充投喂β-胡萝卜素后, HcLPCAT1基因在肝胰腺、中央膜、边缘膜各组织中表达量极显著上调(P<0.01),同时相应组织中总类胡萝卜素含量(TCC)极显著升高(P<0.01)。采用直接测序法鉴定出三角帆蚌HcLPCAT1基因5个SNP位点的基因型与内壳色存在显著相关性(P<0.05),单倍型分析发现H1、H2两种单倍型为紫色三角帆蚌优势单倍型,H3、H5、H6三种单倍型为白色三角帆蚌优势单倍型。本研究鉴定的HcLPCAT1基因可为解析三角帆蚌类胡萝卜素代谢和壳色形成的机制提供研究基础,筛选出的与内壳色相关SNP及单倍型可用于分子辅助育种。

• 单位
  上海海洋大学