历史上来自大陆的政权或政治势力曾三次收复台湾,其治理之道为国家复归统一后中央政府治理台湾地区提供了借鉴经验。重建国家认同体系应当遵循国族认同、政权认同的双元结构,根据现实需求的不同适当调整优先顺序。重建社会治理体系应当发挥政权机构和自治组织协同运行的功能,实现社会资源的优化配置。重建利益分配体系应当针对性解决岛内结构矛盾,推进两岸社会融合。两岸统一后中央政府治理台湾依然可以从这三个维度展开,这不仅构成新时期重建台湾地区治理秩序的主要内容,也是"两制"台湾方案的应有之义。