长链非编码RNA和mRNA在乳腺癌中的差异表达

作者：赵倩; 朱丽萍^*

来源：热带医学杂志, 2022, 22(12): 1636-1759.

• 长链非编码RNA
• 信使RNA
• 乳腺癌
• 差异表达

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)和信使RNA(mRNA)在乳腺癌中的差异表达情况。方法 组织样本采集于2018年9-11月，来自于新疆医科大学附属肿瘤医院。选取5例经病理诊断结果确认为乳腺癌的肿瘤组织及5例经病理证实无肿瘤侵犯的乳腺癌旁正常组织（癌旁组织）。采用博奥晶典长链非编码RNA芯片V4检测乳腺癌组织和癌旁组织lncRNA和mRNA的差异表达。结果 相对于癌旁组织，乳腺癌组织中差异表达上调的lncRNA有551个，下调的lncRNA有959个，乳腺癌组织中差异表达前5位的lncRNA分别是XR＿159043.1、TCONS＿00013634、uc003gdg.1、TCONS＿00009203、TCONS＿00016441。在mRNA表达谱芯片中，相对于癌旁组织，乳腺癌差异表达上调的mRNA有529个，下调的mRNA有1 129个；乳腺癌组织中差异表达前5位的mRNA分别是LEP、PLIN1、ADIPOQ、PRSS56、HEPACAM。根据所得差异表达的mRNA，通过基因本体论（GO）的数据库，疾病的富集分析可以观察到，富集到的疾病包括免疫系统疾病、获得性免疫缺陷综合征（AIDS）、肿瘤、中枢神经系统肿瘤等。富集到的京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路包括磷酸化腺苷酸活化蛋白激酶（AMPK）信号通路、磷脂酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、非受体酪氨酸激酶-信号转导及激活转录因子（Jak-STAT）信号通路、Ras信号通路、叉头框蛋白O(FoxO)信号通路。结论 通过lncRNA芯片技术筛选出与乳腺癌相关的lncRNA与mRNA，为下一步探究lncRNA和mRNA在乳腺癌中的作用机制奠定了研究基础。

• 单位
  新疆医科大学附属肿瘤医院