高通量测序技术在微生物分子生态学研究中的应用

作者：王新珍; 王凤花; 孙瑞波; 刘彬彬^*

来源：中国生态农业学报（中英文）, 2018, 26(10): 1593-1600.

DOI：10.13930/j.cnki.cjea.180695

• 高通量测序
• 微生物分子生态学
• PCR产物测序
• 宏基因组学
• 病毒

微生物在众多的自然和人工生态系统中发挥着核心的作用,但能够被培养分离的微生物在大部分生态系统中只占极少一部分,极大地限制了人们对微生物组成、功能及其潜在应用的认识。分子生物学方法,尤其是高通量测序技术应用到微生物生态学研究中,为认识微生物多样性、群落结构组成及其生态功能提供了有利手段。高通量测序作为一种新兴的免培养分子生物学技术,具备检测快速、准确、信息全面丰富等特点。随着高通量测序技术的不断升级换代,测序通量、读长和准确度的不断提升以及成本的大幅下降,该技术在过去十几年间被迅速应用于土壤、水体和肠道等微生物区系的研究中。本文简述了基于高通量测序技术的PCR产物测序技术和宏基因组学测序技术的原理、发展历程、数据分析方法与应用,以及宏基因组学测序技术在病毒学领域的应用,以期为微生物分子生态学研究提供参考。

• 单位
  中国科学院遗传与发育生物学研究所农业资源研究中心