长苞铁杉nrDNA ITS区假基因化拷贝的克隆及序列分析研究

作者：阚显照; 乔才元; 朱国萍; 杨福生

来源：激光生物学报, 2007, (02): 208-215.

• 长苞铁杉
• 核rDNA
• 假基因
• 克隆
• 序列分析 Nothotsuga longibracteata
• nrDNA
• pseudogene
• clone
• sequence analysis

NrDNA作为一个重要的工具,在许多分类等级上被广泛地应用于系统发育的分析。以长苞铁杉(Nothotsuga longibracteata)为实验材料,通过nrDNA ITS区特异拷贝的克隆及假基因化分析,在序列水平上探讨假基因化的特征,进而探讨引起多拷贝基因家族假基因化的分子机制。实验结果表明:假基因化拷贝的序列长度为1 745 bp,比其它拷贝短11 bp-12 bp;GC含量明显偏低,特别是5.8 S区和ITS2区的GC含量分别比其它克隆低6.15%-6.17%和5.75%-6.15%;5.8 S区和ITS2区序列变异大,遗传距离(d)分别为0.0718+0.0221和0.0691+0....

• 单位
  生命科学学院; 系统与进化植物学国家重点实验室; 中国科学院植物研究所; 安徽师范大学