2型糖尿病差异表达基因筛选及其调控网络构建

作者：程学英; 彭益彬; 孙杰; 潘凌鸿; 刘奔^*

来源：莆田学院学报, 2021, 28(05): 41-48.

• 2型糖尿病
• 基因
• 差异表达
• 调控
• 生物信息学

运用生物信息学方法对2型糖尿病(T2DM)易感基因进行筛选、分析,从分子水平探讨T2DM发病机制。利用GEO数据库查找T2DM患者外周血单个核细胞差异表达的基因集;利用DAVID数据库进行GO功能富集分析、KEGG信号通路分析;利用STRING工具与Cytoscape软件及MCODE插件对差异表达基因做蛋白质互作网络分析。结果如下:1) GO功能富集分析显示T2DM差异表达基因主要分布在G蛋白偶联受体信号通路、细胞增殖分化、信号转导等生物过程中,大部分与神经传导相关; 2) KEGG信号分析结果显示差异表达基因主要集中在神经活性配体-受体相互作用信号通路、Ras信号通路等通路; 3)共得到可信度较高的RAC1、PIK3R1、CDC42等12个关键基因。可见T2DM的发病受到炎症反应、氧化应激及神经信号转导等多种因素的影响。

• 单位
  神经内科; 莆田学院; 莆田学院附属医院