苜蓿质膜内在蛋白编码基因MsPIPs家族的密码子偏好性分析

作者：张海霞; 王玉道^*; 许雪妮

来源：江苏农业学报, 2021, 37(06): 1393-1399.

• 质膜内在蛋白
• 密码子偏好性
• 自然选择
• 突变

利用CodonW软件分析苜蓿质膜内在蛋白编码基因(MsPIPs)的密码子组成,发现它们的密码子在碱基使用中存在偏倚,偏好使用以T/A结尾的密码子,其中T结尾的密码子出现频率为47%。MsPIPs密码子的平均有效密码子数(ENC)为45.47个,偏好性较弱。通过主成分分析(PCA)、对应性分析(COA)、偏倚分析(PR2)、有效密码子数分析(ENC plot)和中性分析等多重分析方法对苜蓿MsPIPs密码子偏好性的成因进行分析,发现苜蓿MsPIPs的偏好性主要受自然选择的影响。

• 单位
  民勤县林业技术推广站