我国行政事业单位体制改革不断深入以后,其内部控制优化相关问题越来越受关注,就当前的实际状况来看,行政事业单位内部控制其制度、机制、监管等方面都还存在较为明显的需要改进的方面。规范内部控制,加强行政事业单位的廉政风险防控机制建设,切实提高其内部控制的意识理念,让内部控制渗入到单位内部的各个方面以运行在整个工作过程,使之切实体现出行政事业单位内部管理水平,已然是对行政事业单位的提出的更高要求和重要工作。本文阐述了行政事业单位内部控制存在的部分问题,并提出相应的优化方法对其展开探讨。