在整体政府跨部门协同治理理论和实践的基础上,围绕顶层设计、指导监督、发展状况等方面分析当前内部审计指导监督的问题,论述构建新时代内部审计指导监督机制的重大意义,提出了在宏观层面加强统筹协调、完善顶层设计,在中观层面加强横向协同、推动纵向一致,在微观层面加强联络指导、实现深度融合等三个方面的对策建议,为构建新时代内部审计指导监督机制提供有益探索。