基于线粒体控制区的江苏湖鲚群体遗传多样性和遗传结构分析

作者：李大命; 唐晟凯; 刘燕山; 谷先坤; 殷稼雯; 蒋琦辰; 朱凛; 李春宁; 张彤晴^*; 潘建林^*

来源：海洋渔业, 2021, 43(02): 149-159.

DOI：10.13233/j.cnki.mar.fish.2021.02.003

• 湖鲚
• 线粒体控制区
• 遗传多样性
• 遗传结构

为掌握江苏省重要湖泊湖鲚(Coilia nasus taihuensis)群体的遗传多样性和遗传结构,利用线粒体控制区(D-loop)全序列分析了6个湖泊(太湖、滆湖、高邮湖、白马湖、洪泽湖和骆马湖)湖鲚野生群体的遗传多样性水平和群体分化情况。结果表明,6个群体共214尾样本的D-loop序列中,共发现103个变异位点,92种单倍型。6个群体的单倍型多样性为0.726～0.951,核苷酸多样性为0.005 52～0.010 36,6个群体整体的单倍型和核苷酸多样性分别为0.857和0.007 29,表明湖鲚群体的遗传多样性较高,且符合高单倍型多样性和低核苷酸多样性特点。分子方差分析(AMOVA)结果表明,群体间变异百分比为6.20%,群体内变异百分比为93.80%,说明遗传变异主要来自群体内部。群体总的遗传分化系数(Fst)为0.061 99 (P<0.01),两两群体间的Fst显示,滆湖群体与其他群体间存在极显著的遗传分化(P<0.001),而其他群体间无显著分化(P>0.05)。单倍型分子系统进化树和网络进化图显示,6个群体的单倍型形成了2个谱系,但谱系组成与群体地理分布无相关性。中性检验分析结果显示,湖鲚群体进化过程中经历过种群扩张,扩张时间大约发生在0.089～0.160百万年前。研究结果表明,湖鲚群体具有较高的遗传多样性,滆湖群体与其他群体具有极显著的遗传分化,且拥有多个独享单倍型,应将滆湖群体单独作为一个管理单位,其他5个群体作为一个整体进行管理和利用。

• 单位
  江苏省淡水水产研究所