高通量测序研究儿童特应性皮炎患者肠道菌群生物多样性特点

作者：罗瑞静; 彭勇; 刘杰; 王英杰; 武宗琴; 姜珠倩; 李淑; 柴**; 李斌^*

来源：中国中西医结合皮肤性病学杂志, 2019, 18(06): 521-524.

• 特应性皮炎
• 肠道菌群
• 生物多样性

目的探讨特应性皮炎(Atopic dermatitis,AD)儿童患者肠道菌群生物多样性特点。方法根据纳入标准选取35例AD儿童患者为AD组,27例健康儿童作为对照组(N组)。应用Illumina Miseq测序平台对研究对象粪便细菌的16SrRNA基因V3～V4区进行高通量测序,将测序结果进行肠道菌群差异分析。结果物种分析显示:在N组中,厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门、其他(低丰度物种),分别占到51.79%、39.06%、5.83%、2.43%和0.90%;在AD组中,厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、放线菌门、其他(低丰度物种),分别占到58.36%、29.16%、7.47%、4.39%和0.62%。Pan/Core物种分析显示:AD组较N组总物种丰富度低、核心物种数少。多样性指数比较显示:AD组较N组Shannon数值降低,Simpson数值升高,但二者差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 AD患儿肠道菌群物种丰度及生物多样性与正常儿童存在差异。

• 单位
  上海中医药大学附属岳阳中西医结合医院; 上海市嘉定区中医医院