摘要

目的 应用生物信息学和体外实验的方法探索酮体代谢相关基因ACAT1在膀胱癌(bladder cancer, BCa)中的表达及意义。方法 在癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)和基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库中对BCa相关的表达数据进行差异分析。制作韦恩图取交集筛选出BCa中具有差异表达的基因。通过检索PubMed筛选出酮体代谢相关基因,进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encylopaedia of genes and genomes,KEGG)富集分析,明确筛选的基因参与酮体代谢调控通路。将酮体代谢相关基因与具有差异表达的基因取交集得到酮体相关的BCa差异表达基因。在TIMER2.0数据库通过Wilcoxon秩和检验对比ACAT1在BCa和正常膀胱组织中的表达水平;在HAP数据库寻找ACAT1在BCa中表达的免疫组织化学染色数据;在Ualcan数据库探索ACAT1的表达与BCa临床性状之间的关系;使用Kaplan-Meier生存曲线探索ACAT1对BCa患者预后的影响;基于TIMER2.0数据库使用多因素Cox回归探讨ACAT1对患者预后的预测能力,并分析ACAT1表达与免疫细胞浸润的关系;体外功能学实验验证ACAT1的生物学功能。结果 BCa中ACAT1表达水平显著低于正常组织,差异有统计学意义(P <0.01),与多种临床性状呈正相关(P <0.01)。Kaplan-Meier曲线提示,高表达ACAT1的BCa患者总体生存率低于低表达ACAT1的患者,差异有统计学意义(P <0.01),结合年龄及临床分期的多因素Cox回归提示,ACAT1可以作为影响预后的独立危险因素(P A<0.05)。TIMER2.0分析发现,ACAT1与BCa的免疫浸润呈正相关(P1 <0.01)。体外实验验证,敲低CAT1可以促进BCa的增殖、迁移和侵袭(P <0.01)。结论 酮体代谢相关基因ACAT高表达可能抑制BCa的发生,可能对BCa患者的预后产生不良影响。

  • 单位
    山东大学齐鲁医院