2018年云南省思茅地区猪场蚊PCV2检测及ORF2基因遗传进化分析

作者:李金凤; 哈卓; 李成辉; 赵冠宇; 李卓昕; 张涵; 郭影成; 鲁会军*; 张英*; 金宁一*
来源:中国病原生物学杂志, 2019, 14(07): 746-754.
DOI:10.13350/j.cjpb.190702

摘要

目的了解云南省思茅地区猪场蚊携带猪圆环病毒2型(PCV2)情况及蚊源PCV2的遗传进化特征。方法采集云南省思茅地区3个猪场周围蚊标本94份并检测PCV2携带情况,PCR扩增ORF2基因,对得到的ORF2基因进行同源性、系统进化树分析和抗原位点比对分析。结果 PCR检测蚊PCV2阳性率为15.96%(15/94),得到的14个ORF2序列之间的核苷酸同源性为89.5%~99.9%,对应氨基酸同源性为86.2%~99.6%;与NCBI GenBank收录的22个参考ORF2序列的核苷酸同源性为79.9%~99.9%,对应的氨基酸同源性为79.5%~99.6%。系统进化树分析PCV2a亚型1个,PCV2b亚型5个,PCV2d亚型8个。抗原位点比对分析显示,PCV2 Cap蛋白氨基酸变异位点主要位于50-70aa,131-140aa,200-220aa 3个区段。结论云南省猪场蚊PCV2携带率较高,主要毒株为PCV2b和PCV2d亚型,且以PCV2d亚型较多,与我国当前猪感染PCV病毒型群体内流行情况相符。

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