水稻半纤维素支链合酶基因GT61家族的结构特征和组织表达分析

作者：易晓燕; 李丰成; 郭凯; 张冉; 李旭凯; 王友梅; 彭良才; 谢国生

来源：中国农业大学学报, 2015, 20(01): 19-28.

• 水稻
• 半纤维素
• OsGT61基因家族
• 结构特征
• 基因表达

从生物信息学和基因表达的角度,鉴定OsGT61家族成员的结构特征和组织表达特性。结果表明,OsGT61家族含有25个成员,分为3个亚类。A、B和C亚类分别含有19、3和3个成员,其基因的外显子数介于17个。其蛋白质大小为49.173.8ku,pI为5.410.4。该家族蛋白质的C端motif较为保守。而且,它们含有Ser/Thr激酶的磷酸化位点分别为929个和313个,Tyr激酶的磷酸化位点小于7个。但是,该家族成员的糖基化位点相对较少,16个成员存在14个O-糖基化位点,3个蛋白存在12个N-糖基化位点。基因表达芯片聚类分析和半定量RT-PCR检测表明,OsGT61基因家族主要成员在不同组织中表达水平存在明显差异。这些结果暗示OsGT61家族基因在水稻不同组织中细胞壁半纤维素生物合成中发挥不同作用。

• 单位
  作物遗传改良国家重点实验室; 生命科学技术学院; 华中农业大学