湖州河川沙塘鳢群体线粒体DNA cyt b基因序列的遗传多样性分析

作者：卞玉玲; 刘士力; 刘一诺; 贾永义; 李飞; 迟美丽; 郑建波; 程顺; 顾志敏^*

来源：水产学杂志, 2023, 36(01): 22-35.

• 河川沙塘鳢
• 线粒体DNA
• 细胞色素b基因
• 遗传分化

河川沙塘鳢具有肉鲜味美，细嫩可口的特点，营养价值与经济价值颇高，是一种极具发展潜力的水产养殖品种，对野生和人工繁育河川沙塘鳢的遗传结构进行检测分析，可为选育和种质保护提供参考资料。本文对湖州河川沙塘鳢(钟管野生群体及八里店养殖群体)的线粒体细胞色素b(cyt b)基因全长进行扩增和测序，并应用生物信息学软件与Gen Bank中太湖、鄱阳湖和巢湖3个群体的数据进行比较。河川沙塘鳢cyt b基因全长1141 bp,4种碱基在所得序列中平均含量为A(26.8%)、G(13.8%)、T(28.0%)、C(31.4%)，序列分析显示，cyt b基因序列中变异位点378个，占分析位点的44.26%，含有241个简约信息位点，平均转颠换比值(TS/TV)为0.76。在5个群体138个个体中共检测到75个单倍型，平均单倍型多样性为0.869～1.000，核苷酸多样性为0.01431～0.03848。各群体间遗传距离差异较大(0.01493～0.05868)，其中八里店与钟管群体的遗传距离最小(0.01493)，而鄱阳湖与巢湖群体的遗传距离最大(0.05868)，与构建的聚类图分析结果一致。群体中性检验显示八里店、钟管和太湖的Tajima’s D和Fu’s Fs值为正值；鄱阳湖和巢湖群体为负值，5个群体Tajima’s D和Fu’s Fs检验均不显著(P>0.01)。总体上，5个群体间具有较高程度的遗传分化。除了湖州的八里店与钟管群体共享6种单倍型外，其他群体间基本不共享单倍型，这可能是八里店养殖群体亲本来源于钟管野生群体的原因。应用cyt b基因可以明确地将湖州、太湖、鄱阳湖和巢湖群体之间区分开来。

• 单位
  浙江省淡水水产研究所; 上海海洋大学