儿童肥大腺样体滤泡树突状细胞精细分群及发育路径分析

作者：杨颖超; 王圣明; 刘峰; 苏开明

来源：山东大学耳鼻喉眼学报, 2022, 1-10.

• 单细胞转录组测序
• 滤泡树突状细胞
• 腺样体肥大
• 生物信息学分析
• 发育路径

目的 探讨儿童肥大腺样体组织滤泡树突状细胞（FDC）的基因表达特征、精细分群、发育路径及转录调控网络。方法 采用单细胞转录组测序技术结合生物信息学分析手段，明确儿童肥大腺样体组织FDC的基因表达特征及亚群分群信息；通过KEGG、GO、irGSEA等基因功能富集分析方法，阐述不同FDC亚群生物学功能；利用拟时序分析，探索FDC亚群间的发育关系；运用SCENIC分析方法描绘不同FDC亚群的转录调控网络。结果 共获得6个FDC亚群，功能富集结果显示它们具有不同的功能；拟时序分析结果显示各亚群的发育分化轨迹起始于CXCL14~(+)APOD~(+)FDC与SLCO2B1~(+)PAPPA~(+)FDC；转录因子调控网络的分析结果提示FDC的SCENIC分群与Seurat分群并非完全重合，多组间存在较大比例的交叉。结论 儿童肥大腺样体组织内包含多个FDC亚群，具有多种功能，存在连续的发育分化关系，部分亚群受到相同的转录因子网络的调控。

• 单位
  上海交通大学; 上海交通大学医学院附属第六人民医院