Disprot无序蛋白数据库分析与统计

作者：张欢; 李盘靖^*; 王彤

来源：山东理工大学学报(自然科学版), 2018, 32(06): 67-70.

DOI：10.13367/j.cnki.sdgc.2018.06.014

• 无序蛋白
• 氨基酸无序倾向性
• 数据库分析

无序蛋白是一种在天然条件下没有稳定的三维结构但却能正常行使重要生物学功能的一类蛋白质.实验以Disport无序蛋白数据库为基础,经过CD-HIT去重处理建立数据集.分别选择20种氨基酸在无序区与有序区中的分布和无序倾向性两个方面对该数据集进行对比分析.结果表明,氨基酸Ala、Asp、Glu、Gly、Lys、Pro、Gln、Ser具有形成无序区的倾向.氨基酸Leu、Thr、Val虽然在无序区和有序区中都具有倾向性,但在由DP值得到的分析中,Leu、Thr、Val不易于形成无序区;氨基酸Gln虽然在无序区和有序区中都不具有倾向性,但在DP值分析中却易于形成无序区.氨基酸Ala、Glu、Ser在二元组氨基酸对中使用最频繁.

• 单位
  山东理工大学