烟草丙酮酸脱羧酶的生物信息学分析

作者:王天龙; 梁永标; 何俊龙; 李江美; 李春荣; 高文佑; 官崇植; 苏家恩*
来源:黑龙江农业科学, 2020, (02): 24-27.

摘要

为进一步了解烟草丙酮酸脱羧酶的特性及功能,采用NetPhos 3.1Server、Meme和Wolf Psort工具获取烟草丙酮酸脱羧酶的磷酸化位点、保守基序和亚细胞定位的相关信息并进行分析。结果表明:丝氨酸和苏氨酸磷酸化位点数以NtPDC1成员较多,酪氨酸磷酸化位点数以以NtPDC3成员较多;烟草丙酮酸脱羧酶成员中共检测到7组保守基序,以Motif 1~6较为保守,NtPDC6缺失Motif 7,除Motif 5外,其他他保守基序均作为序列功能结构域的重要组成部分;NtPDC1、NtPDC2和NtPDC3定位于细胞质,NtPDC4定位于线粒体,NtPDC5和NtPDC6定位于内质网。