基于线粒体Cyt b基因和D-loop区序列的长麦穗鱼遗传多样性研究

作者：杨晓鸽; 夏美琪; 姜洁晨; 汪健; 陈娜; 廖梦绮; 连玉喜^*

来源：中国水产科学, 2023, 30(08): 1031-1041.

• 长麦穗鱼
• Cyt b基因
• D-loop区
• 遗传多样性
• 遗传结构

为研究长麦穗鱼(Pseudorasbora elongata)的遗传多样性现状,本研究利用线粒体Cyt b基因和D-loop区序列,分析了长江中下游安徽境内皖南山区的闪里(SL)、历口(LK)和石台(ST) 3个长麦穗鱼群体的遗传多样性及遗传结构。结果显示,基于Cyt b和D-loop序列定义的单倍型数分别为18和27,整体单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(π)分别为0.792和0.01332、0.777和0.01140,2个标记均显示ST群体遗传多样性相对最低;群体间的遗传距离为0.00173～0.03615 (Cyt b)、0.00193～0.02639 (D-loop);遗传分化指数(Fst)和基因流(Nm)均表明ST群体和SL及LK群体间存在显著的遗传分化;分子方差分析(AMOVA)表明,长麦穗鱼群体间的遗传变异(94.60%、90.69%)远高于群体内(5.40%、9.31%),遗传变异主要来自群体间;单倍型系统进化树及网络结构图分析显示,SL和LK群体遗传关系较近,聚为一支,而ST群体单独聚为一支,形成明显的地理谱系格局;中性检验和核苷酸错配分布图表明长麦穗鱼整体近期历史上未发生扩张事件。总体来看,长麦穗鱼遗传多样性丰富,但各群体内的遗传多样性相对较为贫乏,建议将ST群体作为一个保护管理单元进行优先保护,本研究可为长麦穗鱼种质资源保护和可持续发展与利用提供参考。

• 单位
  生命科学学院; 安庆师范大学