单细胞RNA-seq数据缺失元素补全算法

作者:崔璐; 刘桂锋*
来源:吉林大学学报(理学版), 2020, 58(05): 1229-1231.
DOI:10.13413/j.cnki.jdxblxb.2020054

摘要

基于非负矩阵分解模型,提出一种新的数据补全算法.该算法通过循环遍历确定最佳构造矩阵和rank值,解决了单细胞转录组测序(RNA-seq)数据中存在缺失值的问题,避免了由于单细胞测序深度不足对细胞分型分析的影响.在慢性粒细胞白血病单细胞测序数据上的实验结果表明,由补全算法恢复缺失值后的细胞分型更清晰,验证了该算法的有效性.

  • 单位
    吉林大学中日联谊医院

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