马铃薯Y病毒两个黑龙江烟草分离物的全基因组序列分析

作者：姜瀚林; 程林发; 姜鹏超; 郭兆奎; 刘永中; 李向东^*

来源：中国烟草学报, 2019, 25(03): 67-75.

DOI：10.16472/j.chinatobacco.2018.322

• 马铃薯Y病毒
• 基因组全序列
• 系统发育分析
• 重组分析

为明确黑龙江烟区马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)分子株系和进化特征,从哈尔滨和牡丹江感病烟草采集到Harbin和MDJ两个样品,通过RT-PCR扩增了其全基因组序列,并进行了一致率、重组、系统发育和选择压力等分析。结果表明,2个分离物(GenBank登录号分别为MH933741和MH933742)基因组全长均为9699核苷酸。Harbin与MDJ和比利时分离物GBVC 26(JQ969039)一致率最高,为98.5%;MDJ与Harbin和GBVC 26一致率最高,为98.5%。Harbin是美国分离物Oz和瑞士分离物N-605的重组体,MDJ是美国分离物CW和N-605的重组体。利用全基因组序列构建的系统进化树显示,PVY分离物分为9个组,Harbin和MDJ均属PVYN-Wi组。PVY的11个基因均处于负选择,其中NIa蛋白基因的选择压力最大。

• 单位
  山东潍坊烟草有限公司; 山东农业大学