重庆市南川地区HPV31 E6基因多态性研究

作者：汪文明; 陈林; 李跃梅; 周靖; 丁正林^*

来源：检验医学与临床, 2019, 16(16): 2354-2356.

• 人乳头瘤病毒
• E6基因
• 多态性

目的研究重庆市南川地区人乳头瘤病毒(HPV)31E6基因多态性,为HPV疫苗设计和HPV防治提供依据。方法采用PCR扩增和导流杂交技术检测HPV31阳性患者宫颈脱落细胞HPV31 E6基因,通过测序并与参考序列对比寻找变异位点。使用ProPred-Ⅰserver和ABC pred server分析HPV31 E6蛋白的二级结构并寻找理想的B细胞免疫表位。结果与参考序列HPV31 REF对比,40株HPV31病毒株中,与参考序列E6基因完全一致的病毒株为10株,占25.0%;HPV31 E6基因突变株14株,占35.0%,其中非同义突变6个,同义突变8个,主要的非同义突变为C520T(A138V)和C285T(H60Y),主要的同义突变为A321T、G404A、A428G和C176T。寻找到理想的B细胞免疫表位10个,最理想的HPV31E6蛋白B细胞预测免疫表位为441PEEKQRHLDKKKRF455和285HGVCTKCLRFYSKVSE301。结论该地区HPV31 E6基因分布呈多态性,该研究数据对HPV的防治和疫苗设计有指导价值。

• 单位
  重庆市南川区人民医院