基于单细胞转录组测序分析儿童腺样体免疫细胞异质性

作者：刘士玉; 崔晶花; 付彤彤; 刘艳粉; 袁静^*; 杨瑞馥^*

来源：军事医学, 2022, 46(10): 768-775.

DOI：10.7644/j.issn.1674-9960.2022.10.009

• 单细胞转录组测序
• 腺样体
• 异质性
• 免疫细胞

目的 通过单细胞测序技术绘制儿童腺样体组织单细胞转录组图谱，分析腺样体免疫细胞的异质性。方法临床获取腺样体组织制成单细胞悬液，利用BD RhapsodyTM单细胞平台和Illumina二代测序技术获得单细胞全转录组数据，最后利用R和Python软件完成聚类分析、伪时间分析、功能分析、转录因子分析等工作。结果 共获得14 618个高质量细胞，可聚类为8个主要细胞类型。作为主要的细胞类型T细胞和B细胞亚群经过非负矩阵分解后，分别聚类得到13和12个亚群，并分析其拟时序轨迹、转录因子调控网络和通路活性。结论 研究绘制了详细的腺样体单细胞转录组图谱，有利于深入了解儿童腺样体免疫细胞异质性。

• 单位
  首都儿科研究所