西红花实时荧光定量PCR内参基因筛选

作者：周琳; 蔡友铭; 杨柳燕; 赵冰雪; 李芳; 张永春^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(22): 7467-7475.

DOI：10.13271/j.mpb.018.007467

• 西红花(Crocus sativus)
• 不同组织
• 内参基因
• 实时荧光定量PCR

为筛选西红花不同组织间稳定表达的最佳内参基因,以西红花的根、球茎、主芽、花丝、叶片、侧芽共6个组织为试验材料,运用实时荧光定量PCR方法分析了18S核糖体RNA (18S rRNA)、肌动蛋白基因(ACT)、转录延伸因子-1α(EF1α)、3-磷酸-甘油醛脱氢酶基因(GAPDH)、微管蛋白基因(TUB)和多聚泛素基因(UBQ)共6个内参基因在不同组织中的表达差异情况。基于Ct值,利用geNorm、NormFinder和BestKeeper分析6个内参基因表达稳定性。结果表明,3个软件筛选出的最佳内参基因略有不同。综合分析结果显示,GAPDH和UBQ表达较为稳定,其次为18S rRNA和ACT,而EF1α和TUB不适合作为西红花不同组织的内参基因。本研究确定西红花q RT-PCR分析的合适内参基因为GAPDH和UBQ,可用于种球发育、花发育、次生代谢产物形成和积累等机理研究。

• 单位
  上海应用技术大学; 上海市农业科学院; 安顺学院