基于对枸杞、姜黄、甘草的生物信息学分析探究GRIN3A在前列腺癌中的治疗意义

作者：王庆哲^*; 张恩崇; 宋永胜

来源：实用药物与临床, 2020, 23(01): 14-20.

DOI：10.14053/j.cnki.ppcr.202001004

• GRIN3A基因
• 前列腺癌
• 中药
• TCGA
• BATMAN-TCM

目的综合分析枸杞、姜黄、甘草在前列腺癌中的治疗作用,发掘新的靶向治疗基因。方法 BATMAN-TCM数据库预测3类药材靶向蛋白基因,使用TCGA数据库筛选出差异表达基因。在Cytoscape中选择候选核心基因,通过生存分析确定最终核心基因。对核心基因进行单基因GSEA分析以及COX回归分析。结果 3类药材共同靶向基因180个,其中在TCGA数据库前列腺肿瘤组织与正常组织间差异表达的基因有11个。Cytoscape中筛选出候选差异基因PTGS2、GRIN3A、CACNA1D。生存分析显示,仅GRIN3A与患者不良预后相关。单基因GSEA提示,GRIN3A相关的生物学活动对前列腺癌的发生发展具有促进作用。单因素及多因素COX回归提示,GRIN3A为疾病的独立预后因素。结论 GRIN3A在枸杞、姜黄、甘草对前列腺癌的治疗机制中发挥重要作用,该基因具有成为前列腺癌靶向治疗位点的潜能。

• 单位
  中国医科大学附属盛京医院