核小体定位模式及其与DNA甲基化位点分布的关系

作者：刘宏德; 孙啸

来源：中国生物化学与分子生物学报, 2011, (03): 248-253.

DOI：10.13865/j.cnki.cjbmb.2011.03.014

• 核小体定位
• DNA甲基化
• 转录因子结合位点
• 转录起始位点 nucleosome positioning
• DNA methylation
• transcription factor binding site
• transcription start site

核小体定位是指DNA双螺旋相对于组蛋白八联体的位置.核小体定位通过限制蛋白结合位点参与基因转录调控.本文利用实验检测的人类CD4+T细胞核小体定位数据,研究了核小体定位在转录因子结合位点(TFBS)和转录起始位点(TSS)附近的分布模式,并分析了在TFBS和TSS周围,核小体定位与DNA甲基化之间的关系.结果表明,在休眠和激活的人类CD4+T细胞中,部分TFBS和TSS周围的核小体定位在动态改变,即在定位和缺失两种状态之间切换.在TFBS周围,核小体定位和DNA甲基化存在一种互补模式,核小体定位与DNA低甲基化相联系;而在TSS周围,两者呈现同步模式,DNA高甲基化伴随高核小体水平.而且,在T...

• 单位
  生物电子学国家重点实验室; 东南大学