随着我国高校学科建设经费逐年增长,自2010年以来江苏省优势学科建设工程已完成了两期,目前已启动了第三期建设工程。如何使学科专项资金使用效益更优,加强学科建设经费的科学管理显得尤为重要。本文以南京农业大学农业资源与环境学科为例,针对本学科专项经费管理过程中存在的不足,提出了几点学院在经费管理方面的建议,助力于学科经费的高效使用,更好地服务于农业资源与环境学科的建设。