1株产VB12球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1的分离、全基因组测序及分析

作者：赵磊; 徐琼; 刘洋^*; 张奕南; 钟江

来源：食品科学, 2023, 44(06): 165-171.

DOI：10.7506/spkx1002-6630-20220418-233

• 发酵食品
• 赖氨酸芽孢杆菌
• VB12
• 全基因组测序
• 基因功能注释

为深入探究球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1(LysinibacillussphaericusC5.1)菌株产VB12的作用机制，利用PacBio Sequel和Illumina NovaSeq PE150相结合的方法对C5.1菌株进行全基因组测序，并对测序数据进行拼接、基因预测及功能注释。结果表明，C5.1菌株基因组为一个环状DNA，不含质粒，大小为4 690 817 bp,GC含量为37.21%，预测得到4 756个编码基因，111个tRNA基因和34个rRNA基因。通过基因本体论、直系同源集、京都基因与基因组百科全书和转运蛋白分类数据库对C5.1菌株基因组进行注释分析，分别匹配到3 095、3 182、4 374个和397个基因。进一步分析发现C5.1菌株基因组中包含从尿卟啉原Ⅲ逐步转化合成VB12的关键酶。本研究为解析C5.1菌株在臭腐乳发酵过程中的代谢机理提供遗传信息基础，也为今后开展发酵食品中VB12的生物合成机制研究提供理论支撑。

• 单位
  复旦大学; 上海市质量监督检验技术研究院; 生命科学学院