摘要

本研究基于冬黑麦低温胁迫的转录本数据,筛选响应低温胁迫的基因ScMIPS2,并对该基因进行克隆和生物信息学分析。经测序比对后分析,ScMIPS2基因CDS区长度为1532 bp,编码510个氨基酸,同时包含四个保守结构域。生物信息学预测表明,冬黑麦MIPS蛋白的理化性质表现为酸性亲水性且为非分泌蛋白,亚细胞定位预测该蛋白主要分布在细胞核和线粒体中。对上游启动子区顺式作用元件鉴定,发现该序列包含响应低温胁迫的转录因子结合域和关键元件,如LTRE元件。qRT-PCR结果显示,ScMIPS2基因在低温处理24 h时达到峰值,随后72 h略有下降。为了检测不同品种冬黑麦的ScMIPS2基因表达情况,对6种不同类型冬黑麦的根和叶进行qRT-PCR,发现大部分品种的冬黑麦ScMIPS2基因在根组织的表达量高于叶组织。本研究为ScMIPS2基因的耐寒机制研究提供思路。