地果的转录组学分析(英文)

作者：石登红; 王继玥^*; 白禹; 张婷; 刘燕; 欧阳柏成

来源：热带亚热带植物学报, 2020, 28(04): 317-328.

• 转录组
• 地果
• RNA-seq
• 差异表达基因

为探究地果(Ficus tikoua)的遗传变异特征,利用Illumina HiSeq-2500平台获取地果的基因表达谱。结果表明,共获得了197 362个转录本,总长度和平均长度分别为114 072 125和577 bp。使用BlastX和BlastN共注释了139 992个转录本(占总数的70.93%)。从3个品种叶片和茎的6对样品中,分别鉴定了12 397、12 340、10 373、94 431、71 830和44 465个差异表达基因,以及注释了126、129、125、134、138和137条代谢途径。这将有助于理解地果的遗传特征,以及不同组织中代谢途径的变化。

• 单位
  贵阳学院