基于DIA LC-MS对Ⅲ期食管鳞癌和食管良性疾病患者外周血外泌体差异蛋白的研究

作者：阿尔孜古丽·吐尔逊; 杨丽菲; 郑树涛; 刘清; 刘涛; 张琪琪; 韩秀娟; 卢晓梅^*

来源：新疆医科大学学报, 2021, 44(06): 659-663.

• 外泌体
• DIA
• 蛋白质组学
• 食管鳞癌

目的研究Ⅲ期食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)患者与食管良性疾病患者外周血外泌体蛋白组学的差异。方法基于数据非依赖性采集高分辨率色谱-质谱技术(data independent acquisition liquid chromatography-mass spectrometry, DIA LC-MS),比较3例Ⅲ期ESCC患者与3例食管良性疾病患者外周血外泌体蛋白种类的差异,并对这些差异蛋白进行生物信息分析。结果通过透射电镜、纳米粒子示踪分析、免疫印迹法鉴定提取粒子为外泌体,在2组样品中共检测到1 018个蛋白。通过对比蛋白图谱,共发现21个差异蛋白。富集分析结果表明功能组分中主要涉及细胞黏附和代谢,细胞组分中主要是胞质成分。而在分子功能中涉及多个酶活性。在对这些差异蛋白进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析后显示:叶酸代谢通路、核糖体蛋白质等代谢过程有差异。结论基于DIA LC-MS技术对Ⅲ期食管鳞癌患者和食管良性疾病患者外泌体差异蛋白分析显示,代谢通路可能在食管癌发生发展中发挥重要作用。

• 单位
  新疆医科大学; 新疆医科大学附属肿瘤医院; 新疆医科大学第一附属医院