小果野蕉microRNAs及其靶基因的生物信息学预测

作者：叶可勇; 陈瑶; 李瑞梅; 符少萍; 郭建春

来源：热带生物学报, 2012, 3(03): 222-227.

DOI：10.3969/j.issn.1674-7054.2012.03.006

• 小果野蕉
• microRNAs(miRNAs)
• 靶基因
• 生物信息学

通过基于表达序列标签(EST)、基因组勘测序列(GSS)和高通量测序基因组序列(HTGS)的同源序列比对搜索,以及一系列的标准筛选,最终预测到属于8个家族的10条小果野蕉miRNAs。在线软件psRNATarget预测到24对miRNAs与靶基因的互作,这些靶基因主要参与小果野蕉的新陈代谢、生长发育以及胁迫响应等过程。

• 单位
  中国热带农业科学院科技信息研究所; 中国热带农业科学院热带生物技术研究所