生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株抗原表位

作者：孙琦; 何为; 马玥; 李渊源; 黄转青; 杨森; 杨飞; 张莹; 徐风华^*

来源：军事医学, 2022, 46(12): 896-917.

• 严重急性呼吸综合征冠状病毒2
• Omicron变异株
• 抗原表位
• 生物信息学

目的 通过生物信息学方法预测新型冠状病毒Omicron变异株的抗原表位，为病毒抗原表位多肽疫苗的设计开发提供依据。方法 以新冠病毒Omicron变异株（GenBank:OM095411.1）为研究对象，利用生物信息学服务器和免疫学工具预测新冠病毒S、M、N、E蛋白的杀伤性T细胞表位、辅助性T细胞表位和线性B细胞表位。同时，基于免疫表位数据库（IEDB）、抗原性预测（Vaxigen）、致敏性预测（AllerTOP）等表位生物学性质分析数据库对候选表位进行生物学性质分析。结果 筛选得到具有抗原性、无毒性或致敏性的杀伤性T细胞表位38个、辅助性T细胞表位15个和线性B细胞表位6个，主要位于S蛋白和M蛋白。结论 抗原表位的预测筛选方法可行，研究筛选出的候选表位，可为开发针对新冠病毒Omicron变异株多肽疫苗提供借鉴。

• 单位
  解放军总医院