WGCNA共表达网络显示CDC45和MCM2与宫颈癌预后相关

作者：李昊晨; 耿静; 张子威; 李素婷^*

来源：承德医学院学报, 2022, 39(04): 277-283.

DOI：10.15921/j.cnki.cyxb.2022.04.011

• 宫颈癌
• WGCNA
• PPI网络
• CDC45
• MCM2

目的 使用加权基因共表达网络分析的方法研究宫颈癌细胞中相关基因表达状况及其与预后的相关性。方法 从美国国家生物技术信息中心(NCBI)的Gene Expression Omnibus数据库中获得104例宫颈癌(CC)和24例正常样本的基因表达数据。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建共表达网络。将表达模式类似的基因汇总组成模块，筛选出与肿瘤相关性最强的模块以及显著表达差异的基因。对差异基因进行GO富集分析和KEGG富集分析，同时构建差异基因的PPI网络。进行生存分析，筛选出与宫颈癌预后及分级显著相关的基因，使用Oncomine在线数据库对该结果进行验证。结果 共表达网络显示MEblack模块与组织癌变的关联性最显著。CDC45、MCM2、CDC6、CHEK1、CDT1、CDC7、MCM10、GMNN、BUB1B、MAD2L1等10个基因为核心基因。GEPIA2生存分析提示CDC4和MCM2与生存期显著相关，并得到Oncomine数据库验证。结论 CDC45和MCM2的表达量对宫颈癌病情发展状态判断以及预后状况的预测具有一定参考意义。

• 单位
  承德医学院; 基础医学院