基于分子网络的癌症基因与非癌症基因的差异性分析

作者：聂亚玲; 余景开

来源：山东大学学报(理学版), 2012, (07): 6-9+29.

• 蛋白质相互作用
• 癌症基因
• 节点度
• 介数
• 最大连接组件 protein-protein interaction
• cancer genes
• degrees
• betweenness
• maximally connected components

研究人类蛋白质相互作用网络中,癌症基因和非癌症基因在拓扑结构上的差异性,进而为潜在的癌症基因挖掘提供重要依据。首先利用多个数据库,构建一个较为全面的人类蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,并搜集已知癌症基因;然后从PPI网络中抽取大量随机样本,并分别统计分析随机样本和已知癌症基因在节点度、节点介数和最大连接组件上的差异程度。得到了如下结果:(1)构建了一个较为全面的人类蛋白质相互作用网络;(2)获得乳腺癌已知癌症基因集;(3)已知癌症基因集和PPI网络随机样本在节点度、节点介数以及最大连接组件等拓扑结构属性上差异有显著性(P<2.2×10-16...

• 单位
  生化工程国家重点实验室; 中国科学院过程工程研究所; 中国科学院研究生院