猪脂肪组织circ IDH2的鉴定及功能分析

作者：李萌; 李娇; 张娜; 路畅; 杨阳; 蔡春波; 高鹏飞; 郭晓红; 曹果清; 李步高^*

来源：中国畜牧杂志, 2021, 57(S1): 136-151.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20210615-02

• 猪
• circIDH2
• ceRNA网络
• ssc-miR-129a-5p
• 脂肪代谢

环状RNA(Circular RNA, circRNA)是一种具有闭合环状结构的非编码RNA,其在脂肪代谢中具有重要功能。本研究旨在鉴定猪脂肪组织中circIDH2,并对其功能进行分析。通过正反向引物扩增、Sanger测序、RNase R酶消化实验及qRT-PCR鉴定猪脂肪组织中的circIDH2,并研究其表达规律;运用RegRNA、TargetScan、RNAhybrid及Cytoscape软件对circIDH2靶向结合的miRNA以及miRNA调控的靶基因进行预测,构建ceRNA网络图。结果发现,circIDH2在猪脂肪组织中确实存在,其在猪各个组织中均有表达,并且随着日龄的增加,其在脂肪组织中的表达量呈先上升后下降的趋势。另外,本研究构建了与猪脂肪代谢相关的ceRNA网络,其中,circIDH2可与ssc-miR-129a-5p的种子序列结合,ACSL4、EBF1和NFIB也可与sscmiR-129a-5p的种子序列结合,是ssc-miR-129a-5p的靶基因。进一步对ssc-miR-129a-5p及其靶基因的表达分析发现,随着日龄的增加,ssc-miR-129a-5p的表达量呈先下降后上升的趋势,与circIDH2的表达趋势相反。ACSL4与EBF1的表达随着日龄的增加呈先上升后下降的趋势,NFIB的表达随着日龄的增加呈上升趋势。由此推测,circIDH2可能通过海绵化ssc-miR-129a-5p进一步调控ACSL4、EBF1及NFIB的表达来参与猪脂肪代谢调控。本研究结果可为circIDH2在猪脂肪代谢中作用机制的研究提供一定的理论基础。

• 单位
  动物科学学院; 山西农业大学