快大型黄羽肉鸡肉品质性状的遗传参数估计和关键基因挖掘

作者：杨欣婷; 郑麦青; 谭晓冬; 赵桂苹; 黄超; 李森; 李韦; 文杰; 刘冉冉^*

来源：畜牧兽医学报, 2021, 52(09): 2416-2428.

• 黄羽肉鸡
• pH
• 肉色
• 遗传参数
• 全基因组关联分析(GWAS)

旨在挖掘快大型黄羽肉鸡胸肌肉品质性状的重要候选区间和基因。本研究以1 923只快大型黄羽肉鸡为素材,于56日龄屠宰并测定屠宰和胸肌肉品质性状;利用"京芯一号"55K SNP芯片进行基因分型,利用传统最佳线性无偏预测(BLUP)、基因组最佳线性无偏预测(GBLUP)和全基因组关联分析(GWAS)等方法进行遗传参数估计和QTL区间/关键基因的检测。结果显示,胸肌pH、肉色L*值和b*值的遗传力中等(0.21～0.38),肉色a*值的遗传力较低(<0.20)。GWAS共鉴定到18个达到全基因组水平潜在显著阈值的SNPs和5个达到全基因组显著水平阈值的SNPs,分别位于3、5(Chr5:48.49～49.06 Mb)、11(Chr11:15.51～15.69 Mb)和28号染色体上,这些SNPs能解释肉品质性状1.51%～8.19%的遗传变异。鉴定到胸肌pH和肉色性状的候选基因ARHGEF18、BCO1、BEGAIN、CDYL2、DLK1、EVL、NSL1、SLC25A47、WARS、ZFYVE26。其中,BCO1是已报道的鸡胸肌肉色b*值的主效基因;SLC25A47属于溶质载体家族成员,影响L*24 h。同时发现,位于5号染色体上的2个单倍型对胸肌pH、肉色性状均有极显著影响。以上结果为黄羽肉鸡肉品质遗传选择方案优化和分子育种技术研发奠定了重要基础。

• 单位
  广西金陵农牧集团有限公司; 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所; 动物营养学国家重点实验室