成年滩羊和小尾寒羊皮肤毛囊差异表达miRNA的筛选

作者：何玉龙; 杨瑞; 庄仁杰; 李勇; 周学章; 吴月红^*

来源：中国畜牧杂志, 2019, 55(08): 47-52.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20181024-08

• miRNA
• 滩羊
• 小尾寒羊
• 皮肤
• 毛囊

为比较miRNA在小尾寒羊和滩羊皮肤毛囊中的表达差异,本研究利用高通量测序技术分析了成年滩羊(TY1)和小尾寒羊(XWHY1)皮肤毛囊组织中miRNAs的表达谱,在2个品种绵羊皮肤毛囊组织中共鉴定出561个miRNAs,其中包括138个已知和423个新发现的miRNAs。鉴定出的miRNAs进行表达量差异分析发现,在TY1与XWHY1共筛选到63个上调和16个下调的miRNAs。对差异表达miRNA靶基因预测后与基因本体数据库(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)比对,分别获得靶基因的注释信息为3 886个和4 449个。GO统计发现,差异表达miRNA的靶基因主要参与代谢过程、催化活性、细胞进程和细胞组分等;而KEGG通路分析表明,4 449个靶基因富集到113个信号通路上,其中在嘌呤代谢、内吞作用和糖酵解/糖异生等信号通路上富集显著。综上,在小尾寒羊和滩羊皮肤毛囊中筛选到的差异表达miRNA可能通过调控其靶基因最终参与了绵羊皮肤毛囊的发育。

• 单位
  医药学院; 宁夏大学; 浙江理工大学